La Universidad de Oxford y Oracle colaboran para identificar variantes de COVID-19

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La aparición de variaciones mucho más infecciosas del virus COVID-19 amenaza con postergar la restauración global y probablemente obstaculizar la inmunidad de las vacunas recientes. Asista a los gobiernos y las comunidades médicas a detectar y accionar sobre estas variaciones mucho más velozmente. La Facultad de Oxford y Oracle han desarrollado un Sistema de Análisis Global de Patógenos (GPAS). Combinación de la interfaz de patógenos escalable de Oxford (SP3) con Oracle Cloud Infrastructure (OCI). Esta idea se apoya en el trabajo de un consorcio respaldado por Wellcome Trust, que incluye a Public Health Wales, la Facultad de Cardiff y Public Health England.

«Esta novedosa y vigorosa herramienta dejará a los científicos de salud pública de institutos de investigación, agencias, servicios de salud y compañías de diagnóstico de todo el planeta contribuir a entender mejor las patologías infecciosas, empezando por el coronavirus». Comentó Derrick Crook, instructor de microbiología en el Departamento de Medicina de Nuffield de la Facultad de Oxford.

“El Sistema Global de Análisis de Patógenos va a ayudar a detallar un estándar global común para la recolección y análisis de este nuevo virus. Tal como otras amenazas microbianas que tienen la posibilidad de perjudicar la salud pública. Esto añade una exclusiva dimensión a nuestra aptitud para procesar datos de patógenos. Nos encontramos motivados de asociarnos con Oracle para seguir nuestra investigación usando esta interfaz de tecnología puntera. —Añadió Crook.

Usado por vez primera para la tuberculosis, el SP3 se ha reutilizado para unificar, estandarizar, investigar y equiparar los datos de la secuencia del SARS-CoV-2.

Generar secuencias genómicas anotadas y también detectar novedosas variaciones y aquellas de interés. El desempeño de SP3 se ha mejorado merced al riguroso trabajo de avance de Oracle. Esto deja un prominente desempeño y seguridad, tal como la disponibilidad global 24 horas cada día, 7 días por semana, del sistema SP3 en Oracle Cloud. El sistema SP3 en este momento dará desenlaces de prueba COVID-19 terminados y estandarizados minutos tras el envío en todo el mundo. Los desenlaces se compartirán con países de todo el planeta en un ambiente seguro.

“La posibilidad de utilizar el cribado de variaciones genéticas a una pluralidad de patógenos va a tener enormes provecho para la salud pública mundial. Este programa, con Oracle como colega, nos acerca un paso mucho más a ese propósito ”, ha dicho Sir John Bell, instructor regio de medicina en la Facultad de Oxford.

Merced a las extensas habilidades de estudio automático en Oracle Cloud en comparación con COVID-19

Los científicos, estudiosos y gobiernos colaborativos de todo el planeta tienen la posibilidad de procesar, investigar, ver y accionar sobre una vasta compilación de datos sobre patógenos COVID-19 por vez primera. Esto incluye la identificación de variaciones de interés y su encontronazo potencial en la efectividad de la vacuna y el régimen. Por poner un ejemplo, los cuadros de análisis del sistema mostrarán qué cepas concretas se están extendiendo mucho más veloz que otras y si los aspectos genéticos contribuyen a acrecentar la transmisibilidad y la fuga de vacunas. Oxford ahora ha procesado la mitad de las secuencias de SARS-CoV-2 de todo el mundo, mucho más de 500.000 en conjunto.

«Hay una necesidad primordial de cooperación mundial en la secuenciación genómica y el cribado de COVID-19 y otros patógenos». El presidente y CTO de Oracle, Larry Ellison, ha dicho. «El sistema SP3 mejorado establecerá un estándar mundial para la recopilación y el análisis de datos de patógenos, lo que dejará a los estudiosos médicos entender mejor el virus COVID-19 y otras amenazas microbianas para la salud pública». concluido.

El próximo paso va a ser prolongar este sistema a todos y cada uno de los patógenos y, al tiempo, ayudar con científicos de centros de investigación, agencias de salud pública y compañías privadas para garantizar que este trabajo logre reportar la toma de resoluciones sobre tácticas de contestación a una patología. pandemia en el mundo entero.

La interfaz va a ser gratis para estudiosos y organizaciones sin ánimo de lucrar de todo el planeta.

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